Bebeğin sindirim sistemi, gerek yapısı gerekse çalışması yönünden, daha büyük çocukların ve yetişkin insanlarınkinden farklıdır. Bağırsaklar, bütün vücut uzunluğunun dört mislidir ve yetişkin bir insanınkinden dört buçuk misli daha uzundur. Bebeğin sindirim sistemi, anne sütünü olduğu gibi, anne sütü yerine kullanılabilen mamaları alacak, sindirecek ve emecek şekilde gelişmiştir. Mide-bağırsak kanalı gelişmesinin büyük bir kısmı süt çocukluğu döneminde tamamlanır ve bebek böylece, artan ihtiyaçlarını karşılayacak gıdaların gerektirdiği uyumu sağlamış olur. Yeni yeni sindirim bezleri oluşur, tükürük bezlerinde, midede, karaciğerde ve bağırsaklarda bulunan bezler giderek daha çok sindirim salgısı vermeye başlar.
Bir Örnek: Süt çocukluğu döneminin ikinci yarısında, mide salgısı, yeni doğmuş bebeğinkine göre iki misline, çocuğun okul yaşında ise (10-15 yaşlar) yaklaşık olarak on misline çıkar. Bebeğin kaka etmesi, aldığı besinlere bağlıdır. Yalnız memeyle beslenen bebeklerde kaka iyi kokulu, altın sarısı renkli olur, ama yeşile çalar sarı, sümüğümsü ya da pütürlü oluşum gösterebilir. Anne sütüyle beslenen bebek günde iki ya da üç kez kaka yapar. İnek sütüyle hazırlanmış mamalarla beslenen bebeğin kakası koyu sarı renkte ve kokuludur. Günlük kaka miktarı, sütle beslenen bebeklere oranla daha fazladır.
